Échantillon de crottin – qu'analyse-t-on dans le crottin du cheval ?

L'analyse en laboratoire d'un échantillon de crottin est une méthode bien connue pour détecter les parasites intestinaux du cheval. Mais les crottins renferment aussi d'autres informations importantes, susceptibles de renseigner sur l'état de santé d'un cheval. Prélever un échantillon de crottin est simple ! Ce à quoi tu dois faire attention et quels résultats d'analyse peuvent être obtenus grâce aux échantillons de crottin, tu le découvriras ici.

Comment prélever un échantillon de crottin chez un cheval ?

Un échantillon de crottin de cheval est facile à obtenir : les chevaux émettent jusqu'à 20 kg de crottin par jour et crottent cinq à 12 fois par jour, à des intervalles d'environ deux heures et demie. Les propriétaires de chevaux peuvent prélever eux-mêmes les échantillons de crottin sans problème, à condition de respecter les points suivants :

• Il est préférable de prélever l'échantillon dans du crottin fraîchement déposé. En cas de besoin, l'échantillon peut aussi provenir d'un tas plus ancien, mais le crottin ne devrait pas avoir plus de 12 heures.
• Prélève le crottin du tas à l'aide d'un gant jetable ou d'un sac de congélation enfilé sur la main, si possible à un endroit qui n'est pas entré en contact avec d'autres matériaux comme la terre, la litière, etc. Une poignée de matériel suffit.  Le laboratoire a besoin d'environ 40 à 50 g de crottin pour l'analyse.
• Retourne le gant ou le sac de congélation sur l'échantillon de crottin et noue-le fermement.
• Pour l'analyse en laboratoire, l'échantillon doit être identifié avec le nom du cheval et la date du prélèvement, idéalement à l'aide d'une étiquette sur le gant ou le sachet de congélation.
• Ensuite, l'échantillon doit être refroidi entre quatre et huit degrés, soit dans un sac isotherme, soit au réfrigérateur.
• Conserve l'échantillon au frais jusqu'à l'envoi.

 Un échantillon de crottin absolument propre s'obtient lorsque le vétérinaire prélève le crottin du cheval par voie rectale. Pour la plupart des analyses, cela n'est toutefois pas nécessaire ! 

Que faut-il prendre en compte lors de l'envoi de l'échantillon de crottin ?

L'échantillon doit être envoyé le plus rapidement possible dans des récipients étanches et incassables, ou apporté soi-même au laboratoire. Les vétérinaires proposent des récipients spéciaux à cet effet.

Astuce : tu peux demander à ton vétérinaire traitant si le cabinet fait appel à un service de coursier vers le laboratoire certains jours, et déposer l'échantillon aux moments les plus opportuns ! Certains vétérinaires réalisent eux-mêmes des analyses de crottin pour la mise en évidence qualitative de parasites.

Combien de temps l'échantillon de crottin se conserve-t-il ?

Plus l'échantillon de crottin arrive rapidement au laboratoire, plus il est fiable. Au-delà de quatre jours de transport et en cas d'exposition à des températures élevées, les résultats de certaines analyses peuvent être faussés. Pour les analyses microbiologiques, la prolifération de germes pendant le transport et le stockage peut fausser les résultats dès un à deux jours !

Qu'est-ce qu'un échantillon groupé de crottins ?

Pour un échantillon groupé de crottins, le crottin d'un cheval est collecté pendant trois jours. Les échantillons sont emballés séparément et étiquetés. Les échantillons groupés sont recommandés ... comme les ténias ou les douves du foie. De même, pour rechercher les causes d'une maladie, un échantillon groupé est plus fiable qu'un prélèvement unique.   

Reconnaître les troubles digestifs au premier coup d'œil

Même à l'œil nu, le crottin peut donner des indications sur d'éventuels troubles digestifs. Ces caractéristiques doivent toutefois toujours être mises en relation avec l'alimentation. Le crottin d'un cheval en bonne santé est brun ou brun verdâtre selon le fourrage de base ingéré, et se présente sous forme de boules brillantes et bien formées. Les anomalies se reconnaissent bien aux changements de forme, de teneur en eau, de couleur et d'odeur du crottin :

• De petites boules de crottin sèches indiquent un transit intestinal ralenti.
• Dans les cas plus graves, comme après une colique de constipation, le crottin est recouvert de filaments muqueux blanchâtres ou jaunâtres.
• Un crottin mou dégageant une odeur de putréfaction désagréable indique un déséquilibre de la flore intestinale.
• Un crottin noir et malodorant peut être le signe d'une inflammation de la muqueuse gastrique.

Lorsqu'on divise l'échantillon de crottin, les boules d'un cheval en bonne santé présentent une structure fine et homogène. Quelques grains de céréales isolés et de plus longs fragments de plantes ayant « échappé » à la digestion ne sont pas préoccupants. En revanche, si de grandes quantités de particules grossières de fourrage sont visibles, il est temps de faire contrôler les dents !

Quelles analyses de crottin ton vétérinaire peut-il réaliser sur place ?

Détermination de la teneur en sable

Lorsque les chevaux sont détenus et nourris dans un paddock sablonneux ou se trouvent sur un pâturage surpâturé, le risque augmente qu'ils ingèrent trop de sable en mangeant et développent en conséquence des coliques de sable. La présence de sable dans le crottin peut être mise en évidence par le vétérinaire directement à l'écurie ou au cabinet : les crottins sont par exemple mis en suspension dans de l'eau dans un gant d'examen, et le sable présent se dépose au fond.

Taille des particules dans le crottin

Le crottin divisé est rincé avec un jet d'eau puissant au-dessus d'un tamis. Si de grandes quantités de particules de fourrage d'environ 4 à 5 mm restent dans le tamis, cela indique un broyage insuffisant du fourrage grossier. Cela permet également de mettre en évidence l'ingestion d'aliments non digestibles comme du bois, de l'écorce ou de la sciure provenant de la litière.

Contrôle du pH du crottin

Le pH du crottin peut être déterminé sur place à l'aide de papier indicateur, après mise en suspension dans de l'eau distillée. Une valeur < 6 signale une fermentation accrue des glucides ou une acidification excessive de l'intestin.

Comment savoir, à partir d'un échantillon de crottin, si un cheval a des vers ?

Une analyse parasitologique permet de déterminer,

• quels parasites colonisent l'intestin du cheval
• à quel degré le cheval est infesté de vers.

Pour la détection des vers, plusieurs méthodes sont utilisées en laboratoire.
Dans la méthode de flottation, l'échantillon de crottin est mélangé à une solution saturée de sel ou de sucre, puis centrifugé. Un échantillon est ensuite prélevé à la surface à l'aide d'une anse et examiné au microscope. Cette méthode convient pour la détection des œufs de strongles, d'ascaris et de nématodes (vers ronds). La teneur en œufs de parasites est indiquée comme faible, modérée ou élevée. Les œufs de ténia sont plus difficiles à détecter, car cette espèce de parasite n'excrète pas toujours des œufs.

La méthode de sédimentation permet d'isoler les gros œufs de vers. Pour cela, l'échantillon de crottin est mélangé à de l'eau puis versé dans un verre à travers un tamis très fin. Le résidu du tamis est rincé plusieurs fois, et le liquide est coloré après la sédimentation. Cela permet de détecter les œufs de la grande douve du foie.

Avec la méthode de migration, les larves de vers pulmonaires peuvent être détectées. Les vers pulmonaires sont toussés par le cheval puis ravalés, ce qui les fait passer dans le tractus digestif du cheval. Pour cette méthode, l'échantillon de crottin est placé dans un tamis posé sur un entonnoir qui débouche dans un petit tuyau pouvant être clampé. L'entonnoir est partiellement rempli d'eau. En présence d'une humidité suffisante, les larves de vers pulmonaires migrent et peuvent être trouvées au microscope.

Les analyses parasitologiques de crottin ne devraient pas être réalisées uniquement en cas de troubles digestifs, mais aussi à intervalles réguliers chez des chevaux sans symptômes. Les laboratoires vétérinaires recommandent, pour un diagnostic plus précis, l'analyse d'un échantillon groupé de crottins.

Pourquoi faut-il déterminer le nombre d'œufs de vers dans un échantillon de crottin ?

Dans le cadre de la vermifugation sélective, le type et la quantité des œufs de parasites présents jouent un rôle déterminant.
Une méthode spéciale (méthode McMaster modifiée) permet de compter au microscope les stades parasitaires présents. Pour cela, une quantité définie de crottin est mise en flottation dans une chambre de comptage, et le résultat est obtenu sous forme de nombre d'œufs par gramme de crottin. Cette valeur exacte peut être comparée à des valeurs antérieures. En règle générale, 200 œufs par gramme de crottin sont considérés comme la limite supérieure à partir de laquelle le cheval devrait être vermifugé.

Attention : cette valeur limite ne s'applique qu'aux petits strongles. Pour les ascaris, un vermifuge doit être administré même en cas de nombre plus faible. Si l'analyse montre qu'un cheval de l'effectif est infesté de ténias, tout le groupe doit être vermifugé !

Quels agents pathogènes peuvent être détectés à l'aide d'un échantillon de crottin ?

En cas de suspicion d'infection bactérienne, les agents pathogènes suivants peuvent être isolés d'un échantillon de crottin grâce à des analyses bactériologiques spéciales :

• Les salmonelles peuvent pénétrer dans le tractus digestif du cheval par le biais d'aliments ou d'eau contaminés par les excréments d'oiseaux ou de rongeurs infectés, et provoquer de graves diarrhées. Leur détection dans le crottin se fait par la mise en culture bactérienne sur un milieu nutritif spécial.
• Clostridies : les souches toxinogènes Clostridium perfringens et Clostridium difficile peuvent être détectées par mise en culture.
• Rhodococcus equi provoque chez les poulains de graves pneumonies et des troubles digestifs. L'agent pathogène peut être détecté dans le crottin par mise en culture et PCR.
• Le diagnostic des rotavirus et des coronavirus peut également être établi à partir du crottin du cheval.

Peut-on déduire l'état de santé intestinale du cheval à partir d'un échantillon de crottin ?

Une analyse microbiologique d'un échantillon de crottin permet uniquement de déterminer quels micro-organismes sont présents dans la dernière portion de l'intestin. Il n'est pas possible d'en tirer des conclusions sur le microbiome intestinal d'un cheval, car il n'existe pas de valeurs de référence pour la colonisation bactérienne utile de la flore intestinale des chevaux.

Même le microbiome intestinal d'un seul cheval n'est pas stable, mais dépend de l'alimentation, des conditions de détention et de l'état actuel du cheval. Une analyse de crottin ne peut donc offrir qu'un instantané !

Attention : les séquençages d'échantillons de crottin envoyés, proposés par certaines entreprises, n'ont aucun fondement scientifique !

Quand faut-il faire réaliser une analyse de crottin ?

L'analyse d'échantillons de crottin est une méthode efficace pour

• déterminer le degré d'infestation du cheval par les vers
• déterminer le type de parasites intestinaux afin de pouvoir traiter le cheval de manière ciblée
• obtenir, dans le cadre de la vermifugation sélective, des données comparatives sur l'infestation parasitaire de chevaux individuels et de l'effectif. Les vétérinaires recommandent deux à quatre échantillons de suivi par an.
• vérifier l'efficacité des vermifuges chez un cheval individuel. Tu trouveras ici plus d'informations sur la vermifugation sélective.
• identifier les causes éventuelles de troubles digestifs.
• isoler les agents pathogènes d'infections bactériennes du tractus digestif.